Hösten är i gång!

Om strömkabeln til ditt elektrofores-instrument går av, så kostar ett nytt set - 500 norska spänn (eller 1000 hos en annan leverantör) - plus moms! Labutrustning och labreservdelar kan tydligen få vara hur dyrt som helst!!!

Hösten på DNA Lab har verkligen kommit i gång nu, skönt! Jag gillar att ha mycket att göra på jobbet, så att jag inte hinner grubbla och/eller känna mig onyttig!

Stjärna i marginalen

 I går levererade den sista av totalt nio nya studenter på DNA Lab sina första sekvensreaktioner till Sekvenslabbet! Alla har fått kurs och handledning av mig; 2 stk vecka 42, 4 stk vecka 45, 2 stk vecka 46 och 1 stk vecka 47. Alla är duktiga och jag är nöjd! De verkar också nöjda och det hoppas jag att deras handledare också är. Trött nu… 🎖

I dag fredag och efter Tysabri-kur åkte jag för första gången en bit av den nya Bybanelinjen, linje 2!

Kristi himm

 Igår fredag:

Rörmokare, Tysabri, jobb (Ericaceae), Vinmonopolet, The Voice-final

I dag lördag:

Slettebakken-inventering, Sletten senter, romanläsning (Renegater av Klas Östergren), spaghettimiddag

Insamlingar

Vortex Genie

Att skörda, att njuta

 Det var så lyxigt att inleda en arbetsvecka som jag har döpt till «Rhododendron-bonanza» med att endast extrahera 4 individer. För att komma i gång igen med metoden innan jag kör på med max antal! Och upptäckte att jag har ganska bra koll! Och det kan betyda att jag klarar deadline 50 DNA-extrakt med god marginal innan semestern! Det känns som att jag kan skörda frukterna av alla timmar, energi och insats som jag har investerat de senaste åren (eller hela min akademiska karriär, va?!).

Last Friday

Fredagen blev bra därför att allt som skulle funka funkade! http://xanthoria.blogspot.com/2019/11/forskningsmaterial.html
Och båda negativerna var negativa. Så lite som behövs för att bli peppad efter en smådeppig vecka!

Submission

Igår var det tisdag, och som vanligt gick jag på frimärksklubben, BFK. Jag var där vid 19-tiden, för vi skulle ha styrelsemöte, där jag är suppleant.
Men innan dess hade jag hunnit med att göra massvis denna oktober-tisdagen:
- Satt upp 60+ PCR-reaktioner (kloningsprojekt för en doktorand som ska bli färid, samma som innan i år)
- Redigerat och fixat sista på manuskriptet, och till sist skrivit brev till redaktören - och äntligen skickat in hela paketet (manuskript, figurer, kartor, tabeller)!
- Varit på projektmöte (say no more)
- Tagit årets influensavaccin på apoteket (service!)
- Provat och köpt ett par svarta byxor, som jag ska ha på alla fester (till exempel på lördag)
- Stickat litegrann på min Campside (mys)

© Alicia Plummer

Tankar en torsdag

Måste köpa en ny kamera. Funderar på att köpa en Olympus TG-5. Verkar vara en bra allroundkamera med möjlighet för makro.


https://www.scandinavianphoto.no/inspirasjon/produkttester/test-av-olympus-tg-5?gclid=EAIaIQobChMIj5qs78aY4wIVmOR3Ch1yUwYoEAAYASAAEgIwf_D_BwE




https://www.olympus.no/site/no/c/cameras/tough/tough_cameras/tg_5/index.html


Jag behöver mer jord till mina balkongväxter.


Annars tänker jag mest på att avrunda vårsäsongen på labbet; imorgon är det fredag, och sedan startar jag semestern (2 veckor). Tänkte extrahera 29 tuber med tallbarr (!) imorgon. Städa lite på kontoret.


Och så har jag några plustimmar på flexitiden samt att kärnarbetstiden är 9-15 på sommaren, så det blir en tidig eftermiddag imorgon. Timmar som jag kan använda att skriva färdigt en del text i vår Xanthomendoza-artikel! Eller bara koppla av och känna på friheten.

Kloning

I kloningsmodus igjen:


https://www.addgene.org/protocols/pcr/


https://www.addgene.org/protocols/pcr-cloning/

Mission accomplished

All sequences for the first run-through of all PCR products from the three markers are delivered now.

I have attached all sequence tables to this email.

I assume that all sequences will be processed by the Seq.Lab. by next week.

Good luck with the data processing and analyses!

I await your instructions for further work to complete the project (for example; extra clones from any of the markers/samples, new PCR product to clone etc).

All the best wishes,

New year 2019

In my mind a dark rainy january Friday; The day has become 17 minutes longer since winter solstice!

https://elsa.elle.se/recept-aleksanders-smoriga-daal/


https://www.protocols.io/view/a-streamlined-ddrad-tag-protocol-for-use-with-the-khuct6w

Tre om dagen

– Det är just då när vi främst ser det mörka som vi kan behöva pusha oss lite extra för att se det ljusa, säger hon.

Två arbetsdagar

I två hela, ganska långa, dagar har jag fokuserat på två projekt i DNA-labbet. Ett med gamla samples av sniglar och ett med lav. Jag kände att jag har behandlat jobbet styvmoderligt under hela processen med ny lägenhet, så nu var det dags att ge lite TLC! Nu har jag precis satt igång två maskiner med sekvenseringsreaktioner och tar en paus. Känns bra! Imorgon levererar jag dem till Sekvenslabbet och så ska jag köra såkallad gel extraction på en hög med PCR-produkter. Hinner gå på en disputation också (åtminstone den inledande presentationen). Och ute är det sommar, jag åt lunch ute, och så är det Sveriges Nationaldag!

Arkiv mitt liv

Vilken tur att jag har en blogg, så jag kan ta reda på när jag gjorde saker!

PCR

PCR steps

Black and blue and bright Friday

Today, Friday, among some other things, I extracted DNA from 96 more individuals blue tits Cyanistes caeruleus (blood & tissue), and did a magnetic bead clean-up of five IonTorrent seuencing libraries. Kind of happy, kind of tired, kind of melancholic (time passes so quickly these days, and I'm still in the twilight zone). Soon, I'll be leaving work to go home (in the fog and neverending rain ;( )... TGIF!

Laziness or efficiency

Försöker slippa hitta på egna protokoll...
"Nå sitter jeg med artiklene og skal prøve å lage en god strategi for PCR på disse mikrosatellittene.
Har noen av dere forslag på ett standard protokoll som vi kunde begynne å teste med? Det hadde gjort jobben min betraktelig enklere;)"

Crows, fish, ticks and mites

Minns du denna? Nu har den blivit citerad i ännu en icke-lichenologisk artikel! Om kråkor.

Running

...ska stanna upp en stund nu när stilla veckan snart är här. Fråga mig om jag är stolt över vad vi producerar på DNA-labbet. Ja, det är jag! Vi och jag utvecklar oss hela tiden. Vilar inte  på lagrarna. Om jag hade kunnat filma hela dagen igår och lägga ut här; wow! PippinPrep, AmPure cleanup, NEBnext amplification, AmPure cleanup again, BioAnalyzer. Fyra DNA-bibliotek klara och placerade i frysen!

Kraschade i soffan igår kväll... Vi såg bl.a. Idol, och en duktig tjej sjöng en fin sång.

Snart påsk. Jag ska jobba, men lågintensivt måndag, tisdag och kanske halva onsdag.

Sildegenetikk

I dag har jag extraherat DNA från 96 sillar. Det är små avklippta delar av fenor som man utgår ifrån. Själva extraktionen gör jag med DNeasy Blood and Tissue Kit (96). Lätt som en plätt!

Jobba!

En liten, men inte så tråkig, sak att göra på jobbet kan vara att motta ett par beställningar med julklappar till DNA-Laboratoriet!

Nya pipetter till labbet!

Ny vortex!