Jättelav!

Äntligen publicerad! "Variation in Ricasolia amplissima (Scop.) De Not. in Norway and Europe – a mere response to climate?" (Lindblom & Blom 2025)

My species

 "One caution is that we confirm Lindblom (2006) that there are common morphological overlaps between  Xanthomendoza galericulata and Xanthomendoza fulva that may make absolute field identification, as indicator species, more difficult."  (Rogers et al. 2007. Aspen Indicator Species in Lichen Communities in the Bear River Range of Idaho and Utah. Evansia 24(2): 34-41.)

Nionde december

Och där satt den!  
2019-12-09 — Graphis Scripta 31(7)published.

Sjätte december

Dagen är 12:47 timmar kortare än vid midsommar. Det är mörkt, speciellt som det inte ligger snö. Men jag är glad, för det är milt och ingen snö och is! I morse öppnade jag balkongdörren och lyssnade på gärdsmygens sång. Inte förrän i år har jag lärt mig att gärdsmyg markerar revir på vintern!

Igår skickade vi sista versionen av vårt reviderade manuskript till Graphis Scripta! Skönt!

P.S. Och nu fick jag artikeln till korrekturläsning!

Tankar en torsdag

Måste köpa en ny kamera. Funderar på att köpa en Olympus TG-5. Verkar vara en bra allroundkamera med möjlighet för makro.


https://www.scandinavianphoto.no/inspirasjon/produkttester/test-av-olympus-tg-5?gclid=EAIaIQobChMIj5qs78aY4wIVmOR3Ch1yUwYoEAAYASAAEgIwf_D_BwE




https://www.olympus.no/site/no/c/cameras/tough/tough_cameras/tg_5/index.html


Jag behöver mer jord till mina balkongväxter.


Annars tänker jag mest på att avrunda vårsäsongen på labbet; imorgon är det fredag, och sedan startar jag semestern (2 veckor). Tänkte extrahera 29 tuber med tallbarr (!) imorgon. Städa lite på kontoret.


Och så har jag några plustimmar på flexitiden samt att kärnarbetstiden är 9-15 på sommaren, så det blir en tidig eftermiddag imorgon. Timmar som jag kan använda att skriva färdigt en del text i vår Xanthomendoza-artikel! Eller bara koppla av och känna på friheten.

Citerad i Ecology and Evolution

En av mina gamla artiklar citeras i Ecology and Evolution:


"Within the field of biodiversity science, researchers have long recognized the importance of sampling design in order to achieve a study’s objectives. According to Lindblom (2009), well‐developed sampling designs within the field of molecular biodiversity science should be formulated around three basic areas: research study questions, research study aims and taxonomic focus."


Jag är inte säker på att jag själv formulerade det så elegant, men ändå känner jag mig smickrad!


Lindblom, L. (2009). Sample size and haplotype richness in population samples of the lichen‐forming ascomycete Xanthoria parietina. The Lichenologist, 41(05), 529–535.
https://doi.org/10.1017/ S0024282909008743

Mitt mysiga rum på Grand Hotel, där jag bodde efter firandet av Ingvar K, 2009.

Dagen efter gick jag en runda i mitt gamla Lund. Kungshuset, 2009.

Busy week

Detta har varit en riktigt rolig (men inte lugn) vecka!


Måndag:
- Gick HMS-runda tillsammans med två andra i laboratorierna i A-blokka (jag är skyddsombud)
- Jobbade med någons lavprojekt i labbet
- Var med på BFK:s "Monteringskurs"


Tisdag:
- Jobbade med någons lavprojekt i labbet
- Var på Horisontföreläsning: "Why is Life Like it is?" (Nick Lane) Jag håller ju på att läsa boken, svårt! Men inspirerande biologi - många åhörare!
- Det blev inte klubb; jag var trött och gick hem (Veckans Brott på TV)


Onsdag:
- Levererade sista (?) lavsekvenserna till sekvensering (någons lavprojekt)
- En artikel jag har varit med att producera kom ut!*
- Gick en stickkurs på kvällen - "Strikke rundt på ermer" Jag var enda deltagaren, och det var nervöst men mysigt! Kul att ha läraren helt för sig själv, nästan tre timmar för 400 kronor.


Torsdag:
- Trevlig serviceman som felsökte vår tvättmaskin i ca 45 minuter på morgonen. Hittade inget fel, trots en ganska allvarlig felindikation. Jag provade en tvätt i går, och det gick strålande!
- Skrev om en nomination jag har lämnat in. Fixade fram mer information som Kommittén ville ha.
- Fick ænnu mera blommor! Tack!
- Kørde en maskin med tvætt och det gick bra!


Fredag:
- Extraherade en spænnande lav (eget projekt)
- Färdigställde och skickade in en nomination och fyra bilagor med information (pust)
- Anmälde förköpsrätt till en lägenhet som snart kommer ut på marknaden, hoppas jag




 Nu är klockan 16.04 och jag ska stänga labbet och gå hem!



*) Øvstedal, D. O., Lindblom, L., Knudsen, K.& Fryday, A. M. 2018. A new species of Acarospora (Acarosporaceae, Acarosporales, lichenized Ascomycota) from the Falkland Islands (Islas Malvinas). Phytotaxa 340(1): 86-92.

Biological Invasions

Ganska häftigt, att citeras i tidsskriften "Biological Invasions", va? "Genetic diversity of native and introduced populations of the invasive house crow (Corvus splendens) in Asia and Africa"

En torsdag ensam hemma

Varken "ensam" eller "hemma" stämmer helt!
 HHB reste klockan halv sju på morgonen, så då var jag ensam hemma cirka en timme. Sedan åkte jag till sjukhuset för min månadliga Tysabri-kur. På Haukeland är man ju inte precis ensam... Efteråt tog jag bussen till jobbet, för att hämta mina glasögon som jag glömde dagen innan... Kollade eposten och åkte sedan Bybanen till Bystasjonen där jag åt lunch. Klockan ett var jag hos frissan, skönt med tvätt och klipp! Efteråt en härlig stund (ganska lång)  på bibblan. Så blev det lite småshopping på Galleriet, innan det var dags att ta sig till Magnus Barfot för att se film. Med biljett som jag hade köpt via appen på min nya iPhone (teknisk uppdatering, som jag är ganska stolt över!). "Fabeldyr og hvor de er å finne" är en härlig och rolig film. Efteråt strosade jag mot bussen över den våta Torgallmenningen  i den svarta magiska kvällen, och fantiserade vidare. Hemma ungefär halv tio på kvällen; lagom tycker jag. Och ensam hemma igen! Ikväll kommer HHB tillbaka från möten i Trondheim. Blir mysigt!


Måste njuta denna lite grann - i dag fick jag en epost från U.S.A. med positiv kritik! "...this is a neat article!"

Finally

Åh, jag är så glad att detta samarbetet äntligen kan avslutas - med flaggan i topp!? Puh!


"The cyanomorph and photosymbiodemes are here reported for the first time for Ricasolia virens (With.) H.H. Blom & Tønsberg comb. nov. (≡ Lobaria virens (With.) J.R. Laundon). The cyanomorph of R. virens is dendriscocauloid. The observed early developmental stages involve (1) a free-living cyanomorph and (2) a photosymbiodeme composed of the cyanomorph supporting small, foliose, chloromorphic lobes. Whereas the chloromorph continues to grow, the cyanomorph decays and disappears leading to the final stage (3), the free-living chloromorph. Secondary cyanomorphs emerging from the chloromorph are not known."

Fish, ticks, and mites

För en tid sedan upptäckte jag att en av mina artiklar hade blivit citerad i nyare publikationer om både fästingar och kvalster. I dag såg jag att den även citeras i en publikation om genetisk variation hos fisk! Roligt!

Lucka 2

Öppnar lucka två och hittar ett manuskript, som är antaget och kommer att tryckas i Lavbulletinen! Artikeln har rubriken "Finns Pectenia cyanoloma i Sverige?"

I dag är det inga möten eller dylikt. Jag jobbar bara med att optimisera och försöka få mikrosatelliter att funka! Ute är det 10 plusgrader och regn...

Lucka 1

I första luckan hittade jag en biljett till en konsert i Oslo den 11 oktober 2016!

Häromveckan citerades en av mina artiklar i en artikel om fästingar. I dag fick jag besked om att samma artikel har citerats in en artikel om kvalster...  Jag måste medge at jag inte riktigt förstår vad det är de citerar från min artikel:


"Sample size (i.e. number of measured units of the same

trait) significantly affects the accuracy not only of morphological

variability assessment, or coefficients of variation,

but also values of biological parameters. Indeed, it is impossible

to collect and observe 100% of natural variation of any

parameter. However, larger sample size can go hand-inhand

with more realistic conclusions (Sokal and Rohlf,

 

1995; Randal and Myers, 2001; Cao et al., 2003; Seddon et

al,. 2003; Peres-Neto et al., 2006; Cardini and Elton, 2007

 

Lindblom, 2009; Schneck and Melo, 2010)."

Första veckan

Hur går det med skrivandet? Ett mål för denna veckan var ju: "att skriva färdigt ett första manuskript till två av dem." Om jag ska klara det, så måste jag jobba på bra idag. Men jag är ändå nöjd med processen. Det har varit skönt att ha sommarlov ensam hemma, utan krav, ganska asocialt, men gjort undan en del jobb som låg och väntade här hemma. Och läst! Och ätit glass. Och stickat på en "tote bag". Och pratat med min man. Igår var det värmebölja, 30 grader C. Jag tycker att allt över 24 är för varmt, men det var skönt att sitta ute på balkongen en hel lång kväll, långt efter att solen gick ner bakom Løvstakken klockan 21.40...

Idag är det mulet och inte så varmt, men fortfarade skönt att sitta på balkongen. Dricker kaffe. Och för att ytterligare klydda till min skrivprocess, har jag nu bestämt mig för att starta på det tredje manuskriptet! Men det ska bara bli en mycket kort text, tror och hoppas jag!

My reading and thinking place, Bergen.

Juleferie / jullov: Tankar om skrivande

År 2014 är snart över. Segrar, nederlag och många vardagar.

Mitt lilla mål; två publikationer per år, nåddes med råge:

1) Ekman, S., Wedin, M., Lindblom, L. & Jørgensen, P. M. 2014. Extended phylogeny and a revised generic classification of the Pannariaceae (Peltigerales, Ascomycota). Lichenologist 46: 627-656.

2) Lindblom, L. & Blom, H. H. 2014. Xanthomendoza poeltii is a synonym of X. oregana (Teloschistaceae, lichen-forming ascomycetes). Lichenologist 46: 829-832.

3) Lindblom, L., Meland, K., Thorkildsen, S. & Willassen, E. 2014. DNA-Lab: «Fortidens framtid». In: J. Høyer (ed.), Universitetsmuseets Årbok 2014. Bergen: Universitetet i Bergen, pp. 52-61.

4) Lindblom, L. 2014. Nordia 2014 – «gullet kom hem». Den blaa Løve 4: 7-10.

Skrivklådan håller alltså i sig, men pappersdagboken har jag skrivit alldeles för lite i, vilket är ett nederlag. Att komma igång med den igen blir ett mål för 2015! Vissa samarbeten (no 3) var enklare och roligare än andra (no 1)... Resultatet av samarbete no 2 var den största segern, tror jag. Gransknings- och publiceringsprocessen tog jättelång tid, men det gick! Och en dum dörr till en dum händelse i mitt tidiga doktorand-liv kunde stängas - med en smäll!

Den filatelistiska texten (no 4) är resultat av en härlig seger, som gav energi till att göra ett utkast redan på flyget hem från Oslo. Tacksam för gratistidning på SAS-flyg, med reklamsidor man kan kladda på, riva ut och ta med sig hem!

Årets tips: Ju mer du skriver, desto mer skriver du!

Det blev balkonggran i år!

Lazy Sunday

Andra advent! Håller låg fart, hela regniga dagen. Jag skrev klart en såkallad review på ett manuskript som har skickats in till (namn på vetenskaplig tidskrift). Gøtt! Och lite klædvård, tillsammans med att tænka på jobbveckan som kommer, inklusive festligheter. Nu mørknar det utanfør och snart ska jag laga middag. Och sedan börja jobba med föredrag (15 min), som jag ska hålla på tisdag!

Årbok for Universitetsmuseet i Bergen

Det blir ännu en artikel i år! Tillsammans med Kenneth, Solveig & Endre har jag skrivit en artikel till Årboken. Artikeln handlar om vårt DNA-lab!
"Årbok for Universitetsmuseet i Bergen er en populærvitenskapelig publikasjon med ulike artikler om museets virksomhet natur- og kulturfeltet. Den kan bestilles via museets nettsider eller kjøpes på museet. Årbøkene fører videre en gammel formidlingstradisjon helt tilbake til da museet ble etablert."

If this isn't nice, I don't know what is!

Introducing: Pectenia!

“Our phylogeny… indicates that Degelia ascurrently understood is non-monophyletic and that the monophyletic section Amphiloma should be recognized as a separate genus. Therefore, we introduce the new name Pectenia for this section”

Arterna:
P. atlantica
P. cyanoloma
P. ligulata
P. plumbea

Nöjd!

Jag är faktiskt ganska nöjd med Trebouxia-artikeln! Har jag verkligen skrivit såhär proffsigt?!

"The sequences represent 18 haplotypes, which all belong to the unicellular green alga genus Trebouxia. In contrast to the fungal data set (Lindblom & Søchting 2008), the northern and southern hemispheres share no haplotypes, and in addition, there is an obvious geographical pattern in the photobiont: (1) Genetic diversity is considerably larger in the Arctic-boreal zone than in Antarctica, as measured by number of haplotypes, polymorphic sites, clades, and nucleotide diversity,(2) Samples from Antarctica are clustered in one monophyletic group, whereas samples from the Arctic-boreal zone turn out to belong to four different lineages and/or different Trebouxia species, thus explaining the higher genetic diversity measurements."

och

"The photobiont data from the present study did not allow us to conclude how the bipolar geographic distribution of the lichen X. borealis arose. It maybe any of the processes mentioned above, or a combination of them. However, we can indeed conclude that the mycobiont shows low selectivity for its Trebouxia photobiont. Thus, X. borealis shares a “photobiont-pool” (concept suggested by Beck et al. 1998) with several other lichen-forming taxa, e.g.,species in Cetraria, Flavocetraria, Lecidea and Rinodina.It provides yet another example of a successful life strategy of xanthorioid lichens."

 

Och nu är nästa artikel ute!:

Ekman, S., Wedin, M., Lindblom, L. & Jørgensen, P. M. 2014. Extended phylogeny and a revised generic classification of the Pannariaceae (Peltigerales, Ascomycota). Lichenologist 46: 627-656.

Och senare i höst kommer ännu en i Lichenologist! Utmaningen skrivmässigt just nu är att slutföra första versionen av en text till Universitetsmuseets Årbok!

Semester, semester, semester

Semestern är igång! De sista veckorna på lab var fyllda med jobb, och det mesta handlade om att konstruera DNA-bibliotek och sekvensera med vårt nya instrument: IonTorrent PGM.

Jag arrangerade också årets "DNA-lab spring cleaning" en eftermiddag med efterföljande pizza och social samvaro. Det funkar!

Igår hämtade jag vår hyrbil, som vi ska köra på "släktstur" i Telemark och Vestfold! Det blev en automatväxlad Mercedes, skönt för mig med mitt lilla handikapp.

Nu är jag snart färdig med 150 sekvensreaktioner, som jag ska leverera till Sekvenslabbet. Det är X. calcicola-projektet. "Free-lance lichenology"...

Och så är våran "Short communication", som jag har tjatat om här superlänge, äntligen antagen! Bara några små korrigeringar och lägga till en figur, så!