Friday, January 31, 2014

Goddag fredag

På att göra-listan:
- Aliquot EXO & SAP
- Deponera X. poeltii-sekvens i GenBank
- Buxus: starta upp projektet (primers, protokoll, lab journal)
- Förbereda för Hobbymässan; med Audun 15.00
- Beställa plast, pipetter, filter etc från VWR

Thursday, January 30, 2014

Sköna torsdag

1) Vi Läser i brevlådan när jag kom hem!
2) Förbereder för Bergen Filatelist-Klubs medverkan på hobbymässa i helgen!
3) Antikrundan på SVT!

Tuesday, January 28, 2014

PCR cyclers of the DNA Lab

Jeg har "døpt" den nye PCR-maskinen til McClintock. Barbara McClintock fikk Nobelprisen og sees av og til som en ikon av feministiske vitenskapsfolk. "Hun" er "slave" til Franklin. Litt fra wikipedia:
"Barbara McClintock (June 16, 1902 – September 2, 1992), was an American scientist and one of the world's most distinguished cytogeneticists, the 1983 Nobel Laureate in Physiology or Medicine

In the summer of 1944 at Cold Spring Harbor Laboratory, McClintock began systematic studies on the mechanisms of the mosaic color patterns of maize seed and the unstable inheritance of this mosaicism.

McClintock officially retired from her position at the Carnegie Institution in 1967, and was made a Distinguished Service Member of the Carnegie Institution of Washington.[36] This honor allowed her to continue working with graduate students and colleagues in the Cold Spring Harbor Laboratory as scientist emerita; she lived in the town.

Most notably, she received the Nobel Prize for Physiology or Medicine in 1983, the first woman to win that prize unshared, credited by the Nobel Foundation for discovering "mobile genetic elements"; it was more than 30 years after she initially described the phenomenon of controlling elements. She was compared to Gregor Mendel in terms of her scientific career by the Swedish Academy of Sciences when she was awarded the Prize.

McClintock died of natural causes in Huntington, New York, on September 2, 1992 at the age of 90; she never married or had children."

P.S.
"Rosalind Elsie Franklin (25 July 1920 – 16 April 1958) was a British biophysicist and X-ray crystallographer who made critical contributions to the understanding of the fine molecular structures of DNA (deoxyribonucleic acid), RNA, viruses, coal, and graphite. Her DNA work achieved the most fame because DNA plays an essential role in cell metabolism and genetics, and the discovery of its structure helped her co-workers understand how genetic information is passed from parents to their offspring.

Franklin is best known for her work on the X-ray diffraction images of DNA which led to the discovery of the DNA double helix. According to Francis Crick, her data was key to determining the structure to formulate Crick and Watson's 1953 model regarding the structure of DNA. Franklin's images of X-ray diffraction confirming the helical structure of DNA were shown to Watson without her approval or knowledge. This image and her accurate interpretation of the data provided valuable insight into the DNA structure, but Franklin's scientific contributions to the discovery of the double helix are often overlooked."

Monday, January 27, 2014

Pharrell Williams - Happy (Official Music Video)



Ska strax resa hem och montera frimärken!

Friday, January 24, 2014

Ja, alltså

Det är fredag - igen! Denna veckan har jag gelrensat med RMT, hållit labmöte, ordnat med att få inlagt gas (kväve) och säkra elkontakter på lab (plus säkerställt finansieringen!), varit på bokcirkel, varit på Marin Biodiversitet-seminarium, varit på frimärksklubben, fysioterapi på Haukeland (uppfölning), möte med en doktorand, heldags HMS-möte för Universitetsmuseet (igår), fixat en massa löpande småsaker på lab, skrivit på en artikel/short communication, pust... Ja, alltså, jag är ganska mör idag! Just nu laddar jag för att orka klä på ytterkläderna och RESA HEM!

Friday, January 17, 2014

Redan Fredag

Jag tror det var första gången jag såg fram emot Tysabri*-torsdagen på sjukhuset... Hade så mycket att göra denna veckan, mest med förberedelser för installaton av labens nya instrument och med lab introduktionskurs för tre nya användare. Så några timmar med veneflon igår var ren avkoppling! Bäst av allt var att jag kunde gå direkt hem och koppla av och vila. Men jag är trött idag också... Kursen är färdig för min del och dagens möte med hantverkare på Post-PCR-lab är avklarat! Kan jag få gå hem snart?

*) "TYSABRI is thought to keep white blood cells from getting into the brain and attacking nerves."

Sunday, January 12, 2014

Projekt: Tidsprocess

Vad jag menar med rubriken är att tiden går och det gäller att hänga med. Dagens stora händelse: Vi kastade ut julgranen! Tråkigt; vi gillade den så himla mycket. Men nu hade den stått sedan 23 december och drack ganska lite vatten. Efteråt packade vi ner alla julsaker, och jag dammsög hela lägenheten (c. 55 m2).

Det är skönt att vara helt ledig och bra pyssla hemma. Jag har dessutom köpt en tidning och så löser jag sudoku. Till middag blir det ørret, citron, potatis och sås. Visstre du att citron stavas med "s" på norska? C blir S: sitron, sykkel, sivilisert, sitar. Men cello och cymbal!

Saturday, January 04, 2014

Forskningsprocessen; ett exempel

Äntligen kom min artikel i Herzogia! Man kan inte se den på hemsidan ännu*, men jag har särtrycket, som jag fick fredagen den 20 december! Åh, det har varit en lång resa!

Historien började på våren år 2007. Jag var lättare desperat jobbmässigt, eftersom mitt post-doc hade gått ut 2006, och ingen av mina  ansökningar till Forskningsrådet lyckades. Jag sökte då i Synthesys om tre veckors forskningsbesök i Köpenhamn. Och äntligen blev en ansöking beviljad! Naturligtvis ingen lön, men resa, kost, logi och forskning betald! Och så kunde jag tillbringa helgerna i Skåne hos familjen!

23 juli 2007 startade projektet! Det var jag och Ulrik Søchting (som var opponent på min avhandling 1997) som ville genomföra en revision av arterna Xanthoria borealis (nordhemisfärisk utbredning) och Xanthoria mawsonii (sydhemisfärisk utbredning, på Antarktis). De tre veckorna skulle jag i stort sett jobba med att producera DNA-sekvenser. Tillsammans skulle vi studera morfologi och lägga upp strategi för analyser och publikation.

Det började i stort sett bra. Men det visade sig att jag hade fått den algspecifika ITS-primern istället för primern för svampens ITS! Och det är svampen ((mykobionten) som avgör lavarters systematiska placering... Pust; men jag klarade bakslaget och att producera tillräckligt med data till analyserna.

Och jag fick faktiskt tid att uppleva mer än bara laboratoriet under de veckorna! Tivoli, Zoologisk have, grillkväll hemma hos Ulrik och hans familj...

Artikeln publicerades 2008 (Lindblom, L. & Søchting, U. Taxonomic revision of Xanthomendoza borealis and Xanthoria mawsonii (Lecanoromycetes, Ascomycota. Lichenologist 40: 399-409). Men jag kunde inte glömma algsekvenserna och gick länge och ruvade på dem. Till slut i början av 2012, fick jag ändan ur vagnen, hittade sekvens-filerna, editerade och alignade dem. Och jag tyckte att strukturen var intressant, men körde ganska snabbt fast. "Stuckness"... Det var Christian som fick mig på rätt kurs och som tyckte att jag skulle skicka in det färdiga manuskriptet till Herzogia. Jag är så tacksam!  Första versionen var klar i mars 2013.

När kom refereernas "dom"? I början av juli, och det var mycket som måste fixas innan artikeln blev accepterad! Jag blev faktiskt lite förvånad över vilken hög amibitionsnivå refereerna förväntade, tidksriften har inte precis någon hög såkallad impact factor. Men jag gjorde det!!! Skickade in det reviderade manuskriptet i augusti och läste det sista korrekturet i slutet av oktober.

Och nu finns artikeln: Lindblom, L. & Søchting, U. Genetic diversity of the photobiont of the bipolar lichen-forming ascomycete Xanthomendoza borealis. Herzogia 26: 307-322.

Jag är nöjd med att få ut två artiklar av tre veckors intensivt lab-arbete! Ett par personer har definierat den sista artikeln som ett resultat av "serendipity". Jag håller med om att resultaten är så, men analyserna och skrivandet och produktionen av artikeln var hårt arbete, och jag är stolt över att inte ha gett upp!

*) Nu är den på webben!


Tuesday, December 31, 2013

År 2013

Året 2013 är snart över. Fy, så fort det gick! Det betyder att det var ett bra år!?

I januari jobbade jag hårt på lab. Köpte en iPhone.
I februari åkte jag en tur till Skåne och firade födelsedagen, bl.a. med Tutankhamon-utställning.
I mars stukade jag foten är jag skulle hämta hyrbilen till påskhelgen. Vi körde turer till Strøno, Askøy etc.
I april jobbade jag skitmycket med Lophogastrida på lab.
1-4 maj hälsade mamma och pappa på; det snöade... CB var här 16-19 maj och vi firade nationaldagen (17 mai)!
Juni var helt fullpackad med aktiviteter! HHB var jättemycket borta; fältarbete! På midsommarafton var vi hos TE, JS med barn (Smørås). Mysigt och trevligt!
Hela juli hade jag semester - en bra tradition sedan 5 år! 11-22 juli i Skåne hos mamma och pappa. Ca 50 kyrkor (X. calcicola-projektet). Fint väder och mysigt.
1 augusti började jag jobba igen. Det var faktiskt stilla på lab ganska länge efter semestern; skönt! Den 25 var vi på tur till Os, och tittade på Asplenium/Phyllitis scolopendrium - en ormbunke som heter hjorttunga.
I september kom labaktiviteten igång. Mamma och pappa kom hit 12-15 augusti, och vi var bl.a. på teater. Helgen efter reste jag till Sverige för min bästa väninna C skulle ha 50-årsfest! Festen med övernattning var på Sparreholms slott!
I oktober reste HHB och jag till frimärksutställningen Frefil/Frereg 2013. Jag fick bästa resultatet någonsin på mitt exponat: 76 p! Den 13 okt läste jag sista korrekturet på Trebouxia-artikeln!
I november summerade jag att jag hade 7 projekt samtidigt på DNA-lab! Puh! Och massor av möten, bl.a. BIO-HMS-möte. Och så köpte jag fru Naalsunds helsakssamling (Sverige) på Moldenhauers auktion!
I december försökte jag komma ikapp och/eller avsluta! Plus möten, julavslutningar och förberedelser för jullovet...

Det har verkligen varit skönt att "göra ingenting" här hemma. Har haft ledigt över en vecka och var inom jobbet igår och bara plockade undan och städade lite. Det nya IonTorrent-instrumentet har kommit. Det blir nästa års utmaning! Vi har en jättefin julgran och HHB blev glad för Jussi Björling-CDn som jag gav honom i julklapp! Idag har jag lagat desserten som vi ska ha med oss till AH et al. på nyårsfesten ikväll.

Gott Nytt År!

Friday, December 20, 2013

That feeling

Bästa stunden på året, att vara ensam kvar på jobbet, städa skrivbordet, tänka lite, kolla eposten en sista gång och upptäcka att en artikel har kommit på tryck, tänka på andra liknande stunder, känna på känslan, tänka på att jag alldeles strax är på väg hem... Och det är helg och sedan är det julledigt!

Sunday, December 15, 2013

Nobelpriset i litteratur

Alice Munro fick Nobelpris i litteratur 2013. Jag hade önskat en annan kanadensisk kvinna, nämligen Carol Shields. Tyvärr är hennes författarskap avslutat; hon dog för tio år sedan. Båda är utan tvivel läsvärda, men Shields har gett mig mest.

Julklappar

Som vanligt när jag ska köpa julklappar - hittar jag saker som jag själv vill ha! Hittills har jag skickat julklappar till mitt SOS-fadderbarn i Armenien och min guddotter i Tyskland. De flesta julkorten skickade jag idag, men det blir några imorgon också. Klippt luggen och köpt "svineribbe" till julaftonsmiddagen. Imorgon efter jobbet ska jag stryka och hänga upp julgardinerna i köket. Bente och Elias var här en liten stund idag, mysigt. Och på tisdag julfest med jobbet, på Hotel Grand Terminus!

Friday, December 13, 2013

Lucia

Det är Lucia idag, fredagen den 13 december. För mig börjar julstämningen varje år att infinna sig på kvällen den 12, när jag traditionsenligt bakar lussekatter. Jag följer receptet i en gammal upplaga av Vår Kokbok, men med extra socker och ännu mer extra smör. Och försöker låta bli att jobba in för mycket mjöl.

Lucia 2013

Xanthoria - systematik ger mig också julstämning.

Wednesday, December 11, 2013

November försvann

Och vi är halvvägs i december, nästan. Jag jobbar, skriver, läser och går på diverse tillställningar. Och försöker vila för att orka. Det är inte direkt stressigt, men heller inte så mycket tid att skriva dagbok/blogg. Men imorgon kväll ska jag mysa de luxe med årets lussekattsbak!

Och jag missade allt om Nobelpriset... Alls inte likt mig. Men vi var på julavslutning på Bergen Filatelist-klub. Och det var ju trevligt!

Saturday, November 23, 2013

Sälj bilen

Just nu säljer HHB sin Opel Corsa. Jag lyssnar på radio. Lördagen är öppen. Det blir nog bibblan! Och en hög med ren tvätt, som ska strykas. Och ett manuskript, som ska läsas. Möte med den ene medförfattaren på måndag kl. tio.

"Silence is sometimes the best answer." (Dalai Lama XIV)

Friday, November 15, 2013

Snott från "Bokhora"

Nu kör vi en vinterenkät tycker jag! En fredagsenkät, tycker jag!

Senaste bokköp: Köpte en bok på frimärksklubbens miniauktion: Med blyant på Grini de siste 8 måneder (Ragnvald Jørgensen).

Senaste bibblolånen:
Sunset Park (Paul Auster), Pnin (Vladimir Nabokov), Selvfølelsen (Guro Øiestad). Pnin läste jag ut häromdagen.
Senaste utlästa boken: Alltings början (Karolina Ramqvist). Och så Pnin, förstås!

Favorittidning: Vi Läser och Lavbulletinen.

Plats där jag helst läser: I sängen.

Så sorterar jag min bokhylla: 1) Ämnesvis; facklitteratur, poesi, romaner och pocket och 2) alfabetiskt. Det är målet, men men...

En bok som jag minns att jag läste när jag var liten: "Jag minns ju typ alla!" Men t ex Barnen i Hattstugan (Elsa Beskow), Nils Holgerssons underbara resa genom Sverige (Selma Lagerlöf) och allt av Astrid Lindgren och Barbro Lindgren. Och Nalle Puh, Fem-böckerna, alla möjliga hästböcker, osv osv.

Vilken bok i min bokhylla har jag ägt längst: Det ska jag ta reda på i helgen!

Vad ser jag mest fram emot att läsa i vinter: Någonting som inspirerar mig! En utmaning!

Kom-ihåg-länkar

Harry Potter här.

Och hobbit här.

Sunday, November 03, 2013

Project Africa

Det är dags att seriöst börja planera en resa till Afrika. Så himla många val att ta, men egentligen är min enda önskan att få se vilda zebror i frihet! Och lyssna till Afrikas ljud... Tanzania, kanske? Det måste vara bekvämt och jag kan inte vara med på vandringar i naturen, pga benen... Och man borde vara två pga priserna... Fast det hade varit extra spännande att åka ensam, och komma hem som någon som övervunnit fysiska hinder, rädsla och andra faror?!

Zebra; ny vän från Schleich (HHB)! <3 td="">

Wednesday, October 30, 2013

En dag

En dag med sol: IDAG! Om en stund ska jag med museet för att inviga de nya magasinen - spännande!

Tuesday, October 29, 2013

Vintertid

I helgen ställde vi tillbaka klockorna en timme; det var dags att gå över till vintertid, eller, normaltid. det betder ljusare morgnar, men mörkare eftermidagar. Och kvällarna kommer tidigare. En smäll rakt i ansiktet för mig! Tungt, tungt, men det måste gå!